Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
NME1P15531 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME1P15531 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME1P15531 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME1P15531 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME1P15531 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME1P15531 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME1P15531 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME1P15531 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NME1P15531 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME1P15531 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME1P15531 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME1P15531 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME1P15531 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME1P15531 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NME1P15531 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NME1P15531 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NME1P15531 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NME1P15531 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NME1P15531 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NME1P15531 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME1P15531 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME1P15531 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME1P15531 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME1P15531 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME1P15531 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME1P15531 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME1P15531 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME1P15531 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME1P15531 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms