Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHBP07195 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDHBP07195 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDHBP07195 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDHBP07195 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHBP07195 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHBP07195 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHBP07195 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHBP07195 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHBP07195 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHBP07195 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHBP07195 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHBP07195 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHBP07195 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHBP07195 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHBP07195 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDHBP07195 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHBP07195 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHBP07195 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHBP07195 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHBP07195 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHBP07195 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHBP07195 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHBP07195 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHBP07195 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHBP07195 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHBP07195 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHBP07195 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHBP07195 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHBP07195 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDHBP07195 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDHBP07195 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDHBP07195 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHBP07195 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHBP07195 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHBP07195 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHBP07195 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHBP07195 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHBP07195 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHBP07195 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHBP07195 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHBP07195 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHBP07195 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHBP07195 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDHBP07195 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHBP07195 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHBP07195 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHBP07195 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHBP07195 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHBP07195 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHBP07195 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHBP07195 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHBP07195 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHBP07195 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHBP07195 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHBP07195 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHBP07195 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHBP07195 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDHBP07195 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LDHBP07195 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LDHBP07195 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LDHBP07195 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LDHBP07195 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHBP07195 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDHBP07195 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms