Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKAP2O75563 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKAP2O75563 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms