Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GADD45BO75293 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GADD45BO75293 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms