Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
ABCC9O60706 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC41.75■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC41.72■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.27
ABCC9O60706 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC41.65■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
ABCC9O60706 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms