Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNT1O60563 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNT1O60563 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms