Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP9O43818 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP9O43818 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP9O43818 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP9O43818 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRP9O43818 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP9O43818 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP9O43818 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP9O43818 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP9O43818 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP9O43818 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP9O43818 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP9O43818 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP9O43818 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRP9O43818 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP9O43818 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP9O43818 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RRP9O43818 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RRP9O43818 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP9O43818 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP9O43818 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP9O43818 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms