Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHMP2AO43633 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP2AO43633 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms