Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
APAF1O14727 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APAF1O14727 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
APAF1O14727 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APAF1O14727 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APAF1O14727 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APAF1O14727 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APAF1O14727 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APAF1O14727 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APAF1O14727 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APAF1O14727 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APAF1O14727 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APAF1O14727 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APAF1O14727 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APAF1O14727 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APAF1O14727 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APAF1O14727 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APAF1O14727 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APAF1O14727 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APAF1O14727 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
APAF1O14727 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APAF1O14727 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APAF1O14727 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APAF1O14727 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APAF1O14727 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APAF1O14727 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
APAF1O14727 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APAF1O14727 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APAF1O14727 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APAF1O14727 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APAF1O14727 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APAF1O14727 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APAF1O14727 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APAF1O14727 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APAF1O14727 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
APAF1O14727 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APAF1O14727 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APAF1O14727 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
APAF1O14727 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APAF1O14727 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APAF1O14727 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APAF1O14727 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APAF1O14727 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APAF1O14727 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APAF1O14727 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APAF1O14727 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APAF1O14727 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APAF1O14727 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APAF1O14727 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APAF1O14727 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APAF1O14727 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
APAF1O14727 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APAF1O14727 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APAF1O14727 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APAF1O14727 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APAF1O14727 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
APAF1O14727 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APAF1O14727 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APAF1O14727 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APAF1O14727 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APAF1O14727 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APAF1O14727 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APAF1O14727 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APAF1O14727 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APAF1O14727 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APAF1O14727 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APAF1O14727 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APAF1O14727 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APAF1O14727 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APAF1O14727 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APAF1O14727 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
APAF1O14727 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APAF1O14727 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APAF1O14727 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APAF1O14727 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APAF1O14727 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APAF1O14727 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APAF1O14727 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APAF1O14727 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APAF1O14727 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APAF1O14727 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APAF1O14727 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APAF1O14727 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APAF1O14727 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APAF1O14727 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APAF1O14727 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APAF1O14727 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APAF1O14727 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APAF1O14727 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APAF1O14727 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APAF1O14727 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms