Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYSRT1A8MQ03 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms