Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL13PA6NNM8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms