Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TVP23AA6NH52 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms