Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX10Q9Y5X0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms