Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAK1Q9UPV9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK1Q9UPV9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms