Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

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Length 1,477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN1Q9ULB1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
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NRXN1Q9ULB1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
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