Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SALL4Q9UJQ4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SALL4Q9UJQ4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms