Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN11AQ9UI33 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms