Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG4Q9UBN1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms