Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRBP1Q9P2E9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
RRBP1Q9P2E9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRBP1Q9P2E9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRBP1Q9P2E9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRBP1Q9P2E9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
RRBP1Q9P2E9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
RRBP1Q9P2E9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
RRBP1Q9P2E9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
RRBP1Q9P2E9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
RRBP1Q9P2E9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
RRBP1Q9P2E9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
RRBP1Q9P2E9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
RRBP1Q9P2E9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
RRBP1Q9P2E9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RRBP1Q9P2E9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms