Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP39A1Q9NYL5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYP39A1Q9NYL5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP39A1Q9NYL5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP39A1Q9NYL5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP39A1Q9NYL5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP39A1Q9NYL5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP39A1Q9NYL5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms