Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXD4L1Q9NU39 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms