Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TULP4Q9NRJ4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms