Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB6Q9NP58 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB6Q9NP58 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB6Q9NP58 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB6Q9NP58 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB6Q9NP58 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB6Q9NP58 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms