Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC90BQ9GZT6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms