Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ6

NPFFR1, Neuropeptide FF receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPFFR1Q9GZQ6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPFFR1Q9GZQ6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPFFR1Q9GZQ6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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