Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NMES1Q9C002 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms