Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTPBP4Q9BZE4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTPBP4Q9BZE4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms