Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDHR2Q9BYE9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDHR2Q9BYE9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms