Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNF2Q99496 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF2Q99496 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms