Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SIN3AQ96ST3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIN3AQ96ST3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms