Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF560Q96MR9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF560Q96MR9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms