Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD4Q96M96 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms