Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX27Q96L92 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX27Q96L92 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms