Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LRRIQ1Q96JM4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LRRIQ1Q96JM4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
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