Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF496Q96IT1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms