Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDC3Q96F86 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EDC3Q96F86 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms