Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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TRIM63Q969Q1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TRIM63Q969Q1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TRIM63Q969Q1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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TRIM63Q969Q1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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TRIM63Q969Q1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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TRIM63Q969Q1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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TRIM63Q969Q1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
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TRIM63Q969Q1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM63Q969Q1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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