Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TSR2Q969E8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR2Q969E8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms