Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNRQ92752 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNRQ92752 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNRQ92752 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNRQ92752 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNRQ92752 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNRQ92752 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNRQ92752 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNRQ92752 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNRQ92752 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNRQ92752 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TNRQ92752 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNRQ92752 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNRQ92752 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNRQ92752 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNRQ92752 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNRQ92752 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNRQ92752 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNRQ92752 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNRQ92752 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNRQ92752 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNRQ92752 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNRQ92752 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNRQ92752 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNRQ92752 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNRQ92752 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNRQ92752 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNRQ92752 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNRQ92752 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNRQ92752 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNRQ92752 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNRQ92752 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNRQ92752 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNRQ92752 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNRQ92752 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNRQ92752 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNRQ92752 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNRQ92752 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNRQ92752 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNRQ92752 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TNRQ92752 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TNRQ92752 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TNRQ92752 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TNRQ92752 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TNRQ92752 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TNRQ92752 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TNRQ92752 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNRQ92752 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNRQ92752 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNRQ92752 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNRQ92752 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNRQ92752 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNRQ92752 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNRQ92752 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNRQ92752 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNRQ92752 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNRQ92752 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNRQ92752 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNRQ92752 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNRQ92752 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNRQ92752 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNRQ92752 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNRQ92752 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNRQ92752 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNRQ92752 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNRQ92752 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNRQ92752 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNRQ92752 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNRQ92752 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNRQ92752 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNRQ92752 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNRQ92752 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNRQ92752 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNRQ92752 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNRQ92752 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNRQ92752 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNRQ92752 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNRQ92752 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNRQ92752 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNRQ92752 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNRQ92752 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNRQ92752 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNRQ92752 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms