Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SUSD6Q92537 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SUSD6Q92537 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms