Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC89Q8N998 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC89Q8N998 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms