Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZD4Q76G19 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDZD4Q76G19 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms