Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf47Q6ZRZ4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms