Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC73Q6ZRK6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms