Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI47

KCTD18, BTB/POZ domain-containing protein KCTD18, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD18Q6PI47 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCTD18Q6PI47 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms