Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATRNL1Q5VV63 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms