Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC9C2Q5TAH2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9C2Q5TAH2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms