Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1TD1Q5T7N2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
L1TD1Q5T7N2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
L1TD1Q5T7N2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
L1TD1Q5T7N2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
L1TD1Q5T7N2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
L1TD1Q5T7N2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
L1TD1Q5T7N2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1TD1Q5T7N2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1TD1Q5T7N2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1TD1Q5T7N2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1TD1Q5T7N2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1TD1Q5T7N2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1TD1Q5T7N2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1TD1Q5T7N2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1TD1Q5T7N2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms