Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms