Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms